Ο Δανιήλ Παπαδόπουλος ξεκίνησε τα πρώιμα ποδοσφαιρικά του βήματα στον Όλυμπο Δενδροποτάμου. Το 1981, σε ηλικία 18 ετών, μετακομίζει στον Ηρακλή για μόνιμη εγκατάσταση, όπως αποδείχθηκε εκ των υστέρων.
Σε 17 σεζόν πραγματοποίησε 419 συμμετοχές και σκόραρε 64 γκολ. Το περίεργο με την συγκεκριμένη περίπτωση ποδοσφαιριστή είναι πως ο Δανιήλ Παπαδόπουλος δεν είχε μία συγκεκριμένη θέση που να αγωνίστηκε καθ’όλη τη διάρκεια της καριέρας του. Ξεκίνησε ως επιθετικός, μετακινήθηκε στον άξονα και κατέληξε στα μετόπισθεν. Και στις 3 γραμμές του γηπέδου παρέμενε σε άμεση επαφή με τα αντίπαλα δίχτυα!
Αυτή η αμεσότητα στο σκοράρισμα τον κατατάσσει δεύτερο σκόρερ όλων των εποχών για τον Ηρακλή σε αγώνες της Α’ Εθνικής. Επιπλέον, βρίσκεται στην πέμπτη θέση στο κλειστό κλάμπ των 5 ποδοσφαιριστών που έχουν συμπληρώσει περισσότερες από 400 συμμετοχές στην πρώτη τη τάξει κατηγορία του ελληνικού ποδοσφαίρου, εκπροσωπώντας μόνο μία ομάδα.
Οι άλλοι 4 είναι κατά σειρά οι: Γιώργος Κούδας (ΠΑΟΚ), Μίμης Παπαϊωάννου (ΑΕΚ), Ντίνος Κούης (Άρης), Στέλιος Μανωλάς (ΑΕΚ). Συνεπώς, φυσικά και αποτελεί τον ρέκορντμαν του συλλόγου σε συμμετοχές στην Α’ Εθνική.
Οι ομαδικές διακρίσεις του με τον Ηρακλή είναι το Βαλκανικό Κύπελλο το 1985 και το ασημένιο μετάλλιο στο Κύπελλο Ελλάδας του 1987 κόντρα στον ΟΦΗ.